und unter Missachtung von suits Tip, der nur unter speziellen Bedingungen gilt

ja schon, aber was spricht gegen eine simple schleife die aufsteigend zahlen im dezimalsystem ausgibt und dann mittels base_convert in die basis 4 konvertiert und anschließend mit nullen auffüllt?

for ($i = 0; $i <= 100; $i++) {  
  echo str_pad(base_convert($i, 10, 4), 4, "0", STR_PAD_LEFT);  
}

nicht getestet
zudem: die datentypen passen vermutlich nicht so ganz, da str_pad natürlich einen string zurückgibt und keine (ganz)zahl