Wenn ich dich richtig verstanden habe dann so:
<a href="#" onClick="functionXyZ();" title="Alle Hotjobs" rel="floatbox" rev="width:700 height:400 scrolling:no">Klick</a>

In der Funktion "functionXyZ()" kannst du dann dein Alert auslösen.

nein nicht ganz richtig,

statt des alerts den ich standardmäßig in dem anderen script habe will ich meine URL mit den parametern aufrufen und damit eine floatbox (n lightbox clone) aufmachen