Man mag es kaum glauben. Mal wieder. Es hatte nichts mit den Ordnerzugriffen zu tun, nichts mit den Verlinkungen oder dem Script an sich. Er mag sicher nicht der schönste sein, er funktioniert: ich musste die Reihnfolge des Aufrufs der verschiedenen CSS-Datein ändern. Anscheinend hatte ich ausversehen mit einer CSS-Datei etwas anderes ausgehebelt.

Vermutlich durch Inlining