Hallo!

ich habe relativ viele Mails

Was verstehst du denn unter "relativ viele Mails" (in GB)?

und nutze Thunderbird mit IMAP. Irgendwie möchte ich, das der Thunderbird z.B. alle Mails, älter als 90 Tage auf ein Netzlaufwerk speichert.

Die Frage ist eher, warum, bzw. wozu möchtest du das?
Denn normalerweise hast du deine Mails ja bereits einmal auf dem Server und zum anderen lokal auf deinem Rechner (dem mit TB).
Also wozu jetzt noch die Mails extra auf ein Netzlaufwerk verschieben?

Ansonsten ist bspw. per Sieve so ziemlich alles möglich, völlig unabhängig vom verwendeten Mail Client.

Gruß Gunther