GNUCASH als Alternative, aber mir ist keine automatisierte Lösung für Elster bekannt.
Es gab aber Entwickler die sich dem Elster/Gnucash Thema angenommen haben.

Ich übertrage die paar Daten immer händisch ins Online-Portalformular.
Stammdaten werden aus dem hinterlegten Profil übernommen.
Das dauert keine Minute und die Sache ist durch.