Hallo Christoph,
es ist und bleibt nun einmal so: Die sauberste Methode ist eine Neuinstallation. Alles andere macht im nachhinein mehr Arbeit - z.B. wenn du die Fehlersuche mit einrechnest.
Was das Backup und die Vorkehrungen angehen, die man treffen sollte, damit man auch ja wieder alles an seinen Platz bekommt, möchte ich auf die c't Nr. 9 vom 18.4. diesen Jahres (Vollkasko für Ihre Daten) und das c't Special Windows XP aus dem Heise Verlag verweisen. Darin wird ausführlich erklärt, wie man so etwas leicht hinbekommt. In der c't Special wird außerdem erläutert, wie man aus einer Home eine Pro Version und umgekehrt macht.

Es lohnt sich wirklich, jetzt ein paar Stunden mehr Arbeit hineinzustecken, denn als Belohnung bekommt man ein sehr stabiles System (für Windowsverhältnisse... ;-) ).

Beste Grüße

Detlef