Warum muss es JavaScript sein?

Kannst du das nicht per Ajax "irgendwo" hinschicken und einfach Kompare oder vergleichbares ausführen lassen?

weil mein ganzes script auf javascript aufgebaut ist und dieses script lokal auf dem rechner als eine *.hta-datei vorliegt, deswegen.

http://solidcodingarchive.appspot.com/resources/NetDiff.htm

Suchmaschine meiner wahl: "javascript file comparison"