Scripte, die im selben Ordner wie das compile-Script liegen, kann ich problemlos compilieren, wenn ich aber ein Script compilieren will, das woanders liegt, bekomme ich so ein Error: Error: Couldn't find preset "es2015" relative to directory "../path/to/my/directory"

Die Fehlermeldung ist wirklich etwas kryptisch. Ich vermute, dass Babel ausgehend von der zu kompilierenden Datei im Dateisystem aufwärts nach dem Preset sucht. Dort kann es aber nicht gefunden werden, weil du mit ".." aus dem Arbeitsverzeichnis heraus navigierst und dann einen benachbarten Pfad betrittst. Aber wie gesagt, das ist bloß ein Tipp ins Blaue.